Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOFQ13790 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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APOFQ13790 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
APOFQ13790 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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