Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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