Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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