Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP27A1Q02318 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms