Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms