Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
XBP1P17861 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XBP1P17861 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms