Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH1P12830 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms