Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms