Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSF3RQ99062 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSF3RQ99062 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms