Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RNF148Q8N7C7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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