Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms