Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms