Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM72Q6ZMU5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms