Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBR1LQ6UX01 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms