Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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KRTAP27-1Q3LI81 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP27-1Q3LI81 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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