Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GRIK4Q16099 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GRIK4Q16099 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK4Q16099 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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