Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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