Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SEC61A1-205ENST00000483956 3046 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.426e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 SEC61A1-202ENST00000424880 3238 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.486e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.863e-11■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-11■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.363e-11■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ALDOA-208ENST00000562679 906 ntTSL 517.16■□□□□ 0.345e-67■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ALDOA-210ENST00000563987 586 ntTSL 213.19□□□□□ -0.35e-67■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ALDOA-205ENST00000562168 666 ntTSL 312.01□□□□□ -0.495e-67■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.099e-32■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 IFITM2-203ENST00000527146 634 ntTSL 315.23■□□□□ 0.039e-32■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.059e-32■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 IFITM2-206ENST00000616316 892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.569e-32■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 NOL11-209ENST00000583108 2071 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 NOL11-206ENST00000581375 2448 ntTSL 28.19□□□□□ -1.11e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 NOL11-210ENST00000584032 612 ntTSL 26.97□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 NOL11-208ENST00000583021 443 ntTSL 25.84□□□□□ -1.471e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 FAM207A-205ENST00000485207 504 ntTSL 217.22■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RFXANK-206ENST00000535017 546 ntTSL 312.58□□□□□ -0.42e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RFC2-208ENST00000485545 847 ntTSL 39□□□□□ -0.976e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 519.66■□□□□ 0.742e-17■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.622e-17■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-17■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 516.21■□□□□ 0.192e-17■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.284e-10■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.592e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 COTL1-205ENST00000567278 5330 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 531.6■■■□□ 2.652e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 C20orf24-205ENST00000491113 734 ntTSL 230.95■■■□□ 2.553e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.522e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.792e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLN6-208ENST00000567060 945 ntTSL 219.65■□□□□ 0.742e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 DBNL-203ENST00000429716 1622 ntTSL 219.55■□□□□ 0.725e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CXXC1-214ENST00000590901 2562 ntTSL 216.95■□□□□ 0.32e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.112e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PNPO-215ENST00000641709 3232 nt15.43■□□□□ 0.062e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 USP7-210ENST00000565455 3554 ntTSL 25.84□□□□□ -1.472e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.743e-8■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.243e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 GDI2-207ENST00000479928 2499 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-12■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PPP2R1A-202ENST00000391791 979 ntTSL 220.57■□□□□ 0.884e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.017e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPA2-204ENST00000419958 554 ntTSL 36.12□□□□□ -1.437e-7■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LARS-206ENST00000505223 582 ntTSL 313.22□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LARS-216ENST00000618084 720 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.452e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.314e-20■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-20■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-20■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.034e-20■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPL30-207ENST00000520998 747 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-80■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPL30-208ENST00000521112 573 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.091e-80■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RPL5-203ENST00000461952 1116 ntTSL 26.76□□□□□ -1.331e-47■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-6■□□□□ 10.6
PABPC4Q13310 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-18■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 214.57□□□□□ -0.082e-18■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 TMEM147-208ENST00000596232 562 ntTSL 224.56■■□□□ 1.521e-15■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GUK1-225ENST00000481341 333 ntTSL 317.93■□□□□ 0.462e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ILK-211ENST00000530016 1696 ntTSL 214.67□□□□□ -0.064e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.292e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 521.89■■□□□ 1.092e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.082e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 220.89■□□□□ 0.932e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 220.34■□□□□ 0.852e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.832e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-204ENST00000542255 1016 ntTSL 520.08■□□□□ 0.812e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt18.18■□□□□ 0.52e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 ACADVL-219ENST00000579425 1234 ntTSL 518.1■□□□□ 0.492e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 RPS2-212ENST00000532746 931 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-50■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 LSM7-207ENST00000591745 543 ntTSL 215.65■□□□□ 0.16e-8■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NACA-209ENST00000548084 542 ntTSL 314.92□□□□□ -0.021e-22■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NACA-217ENST00000551520 544 ntTSL 28.73□□□□□ -1.011e-22■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NACA-219ENST00000551793 768 ntTSL 27.89□□□□□ -1.151e-22■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.722e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 37.07□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 26.69□□□□□ -1.342e-7■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 DCTD-203ENST00000500813 1829 ntTSL 219.83■□□□□ 0.771e-6■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CCT8-208ENST00000484403 808 ntTSL 37.29□□□□□ -1.242e-11■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CCT8-207ENST00000481059 879 ntTSL 57.2□□□□□ -1.262e-11■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 CCT8-202ENST00000431234 968 ntTSL 56.03□□□□□ -1.442e-11■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.179e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.29e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.29e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.449e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.449e-9■□□□□ 10.5
PABPC4Q13310 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-12■□□□□ 10.5
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