Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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