Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXC1Q12948 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXC1Q12948 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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