Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms