Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms