Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms