Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S2P56377 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms