Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL1P40616 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms