Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms