Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPRY3O43610 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms