Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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