Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOBEC3GQ9HC16 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms