Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ASXL3Q9C0F0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms