Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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