Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKP4Q99569 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms