Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCT8L2Q96SF2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCT8L2Q96SF2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms