Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB6CQ53S08 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms