Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ATRQ13535 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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