Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
STRN3Q13033 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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