Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TGFBR1P36897 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TGFBR1P36897 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms