Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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OTX2P32243 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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OTX2P32243 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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OTX2P32243 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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OTX2P32243 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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