Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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