Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLCO3A1Q9UIG8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms