Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms