Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATA5Q9BWX5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms