Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms