Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA1CQ9BQE3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms