Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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RNF185Q96GF1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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RNF185Q96GF1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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RNF185Q96GF1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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RNF185Q96GF1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RNF185Q96GF1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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