Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ALYREFQ86V81 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms