Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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RTN1Q16799 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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