Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms