Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR1Q03591 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CFHR1Q03591 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms