Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXC5Q00444 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXC5Q00444 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXC5Q00444 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HOXC5Q00444 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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